De geschiedenis van de plaatselijke Hervormde Gemeente gaat terug tot de tijd van de Reformatie. De ene ongedeelde N.H. Kerk van H.I.Ambacht, zich uitstrekkend van Rijsoord tot aan Zwijndrecht, bestreek een groot gebied. Er ontstonden al spoedig twee kernen, te weten: Dorp en Dijk met als uitstulpsels de Burg. van Akenwijk en Hooftwijk. De wijk Dijk is de voorloper van de huidige wijk Elim. De dijk (Veersedijk) en de langs de voet van de dijk lopende Onderdijkse Rijweg kenden tot aan de uitvoering van de Deltaplannen (na de watersnood van 1953) op vele plaatsen een lintbebouwing. Toch was in die ene uitgestrekte Hervormde Gemeente tot na de Tweede Wereldoorlog slechts 1 predikant werkzaam, t.w. ds. B.N.J. Roskott.
Behalve over de Dorpskerk beschikte de Hervormde Gemeente al voor de oorlog aan de dijk over een schuurachtig wijkgebouw, genaamd Elim. Dit gebouw is nu nog terug te vinden aan de binnenzijde van de Veersedijk ter hoogte van Servicebureau Verschoor. Hier werden niet alleen kerkdiensten gehouden, maar ook het verenigingsleven vond er onderdak. In juli 1946 werd goedkeuring verkregen om voor wijk Dijk een tweede Hervormde predikantsplaats te stichten, die in eerste instantie werd vervuld door ds. C. Batenburg. Deze uit Alblasserdam overgekomen predikant werd later gevolgd door ds. M.J. Kalvenhaar.
Inmiddels had de wijkgemeente de naam Elim aangenomen. Aan het eind van de zestiger jaren werd besloten voor wijk Elim een predikant te beroepen van Gereformeerde Bondssignatuur. De namen van ds. C. Baas (1970-1973), ds. H. Stroeve (1975-1983), ds. D. Dekker (1984-1993), ds. F. Hoek (1995-2003) en ds. M.J. van Oordt (sinds 21-8-2005) zijn sindsdien verbonden aan de wijkgemeente.
Het huidige kerkgebouw is de vervanger van de zogenoemde oude Elimkerk, die ter vervanging van het wijkgebouw aan de dijk (zie hierboven), op 5 maart 1951 werd geopend aan de Burg. van Akenwijk. Die locatie werd in de na-oorlogse jaren (1949) gekozen op grond van de toenmalige situatie aan de dijk en de destijds bij de burgerlijke overheid bestaande gedachten inzake de te verwachten uitbreiding van de bebouwing. Als gevolg van de watersnood (dijkverhoging) verdwenen echter vele woningen. Bovendien werden de uitbreidingsplannen van de gemeente drastisch gewijzigd. Beide factoren werkten er aan mee, dat de in 1951 in gebruik genomen kerk hoe langer hoe meer op een eiland kwam te staan.
Vandaar dat in 1987 gezocht werd naar mogelijkheden van nieuwbouw, wat meer centraal binnen de wijkgemeente. De gemaakte plannen konden tot uitvoering worden gebracht en de financiële acties liepen boven verwachting goed. Van de gemeente kon een stuk grond worden gekocht aan de Jan Wissenslaan, waar op 30 maart 1990 de eerste paal kon worden geslagen. Nauwelijks zes weken later, op zaterdag 12 mei 1990, werd de eerste steen gelegd door de toenmalige predikant ds. D. Dekker. Hij bepaalde de talrijke belangstellenden bij die gelegenheid bij enkele woorden uit Psalm 118: Dit is van de Heere geschied en het is wonderlijk in onze ogen. Op donderdag 4 oktober 1990 mocht de kerk, naar ontwerp van de Ambachtse architect ing. J. van Stuyvenberg, gebouwd door Bouwbedrijf Van Maren, in gebruik worden genomen.
De kerkruimte biedt plaats aan 350 - 400 personen, terwijl voor vergaderingen e.d. twee zalen beschikbaar zijn (elk voor ca. 50 personen), die echter ook als een grote zaal kunnen worden gebruikt door verwijdering van een vouwwand. Het aanvankelijk voor de begeleiding van de gemeentezang gebruikte harmonium werd in november 1993 vervangen door een nieuw mechanisch pijporgel (13 stemmen) met twee klavieren en een vrij pedaal, dat gebouwd werd door Gebr. Van Vulpen te Utrecht.